Основаны на использовании паразитических и хищных насекомых (энтомофагов), болезнетворных микроорганизмов, паразитических червей и других естественных врагов в борьбе с вредителями, возбудителями болезней и сорными растениями. Их применение безвредно для человека, сельскохозяйственных животных и культурных растений.
В овощеводстве для борьбы с вредителями широко используется яйцеед-трихограмма. Применяют трихограмму против капустной, озимой совок, лугового мотылька. Заражая яйца насекомых, она уничтожает вредителей до появления гусениц. При своевременном и правильном использовании трихограмма может уничтожить 60-90% яиц капустной и озимой совок.
В последние годы для борьбы с паутинным клещом в закрытом грунте на огурцах широко применяется хищный клещ фитосейулюс, что позволяет значительно сократить или полностью исключить использование инсектицидов.
Из природных энтомофагов очень эффективен апантелес гломератус - паразит капустной и репной белянок. Численность капустной тли в значительной мере ограничивает (на 20-30%) паразит афидиус.
Из хищных насекомых на овощных культурах и картофеле следует охранять жуков божьих коровок (кокцинеллид) и их личинок, а также личинок мух журчалок, златоглазки, которые уничтожают тлей, яйца колорадского жука.
В борьбе с вредителями весьма эффективны микробиологические препараты бактериального и грибкового происхождения. Наиболее изучен и широко применяется бактериальный препарат энтобактерин-3 - против гусениц капустной и репной белянок, капустной моли. Гибель этих вредителей при использовании энтобактерина с нормой расхода 3-4 кг/га в смеси с хлорофосом (0,2-0,3 кг/га) достигает 90% и более.
Боверин получен на основе гриба белой мюскардины. Рекомендуется для борьбы с колорадским жуком. Использование боверина с нормой расхода 2 кг/га в смеси с хлорофосом 0,3 кг/га обеспечивает гибель 90- 95% жуков и их личинок.
В последние годы созданы и применяются новые биопрепараты для борьбы с мышевидными грызунами - бактороденцид зерновой и аминокостный.
В борьбе с болезнями овощных культур все больше используются антибиотики-микробы - антагонисты возбудителей болезней. Среди них - трихоцетин, полимицин, фитобактериомицин и триходермин (против возбудителей корневых гнилей и мучнисторосяных грибов).